Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TTPAP49638 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms