Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TMPOP42166 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TMPOP42166 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TMPOP42166 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TMPOP42166 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TMPOP42166 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TMPOP42166 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TMPOP42166 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TMPOP42166 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TMPOP42166 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms