Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA13P31271 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms