Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms