Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms