Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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