Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms