Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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ZNF548Q8NEK5 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ZNF548Q8NEK5 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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