Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SHC4-203ENST00000537958 1447 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P2-201ENST00000553854 1447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 F11-AS1-202ENST00000508110 1512 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 U3.24-201ENST00000391177 215 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TPI1P1-201ENST00000420977 750 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ISX-AS1-201ENST00000427881 202 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC00853-201ENST00000429328 661 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RFC4-207ENST00000433496 1111 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC004006.1-201ENST00000434994 377 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC012501.2-201ENST00000437634 1281 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC091808.1-201ENST00000438867 786 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 P2RX6P-201ENST00000439119 468 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 C11orf98P1-201ENST00000446114 318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP000926.2-201ENST00000469983 358 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SL242P-201ENST00000491451 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02065-201ENST00000509924 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC136424.1-201ENST00000518425 542 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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ANKRD39Q53RE8 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01588-209ENST00000556019 534 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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ANKRD39Q53RE8 VWA3A-205ENST00000563755 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC132938.1-201ENST00000566971 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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ANKRD39Q53RE8 AL359921.2-201ENST00000608547 543 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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ANKRD39Q53RE8 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC019322.3-201ENST00000616104 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC010507.2-201ENST00000632795 676 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EFCAB10-205ENST00000486180 1550 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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