Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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