Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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VPS72Q15906 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
VPS72Q15906 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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