Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SRSF5Q13243 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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