Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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PTP4A2Q12974 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTP4A2Q12974 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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