Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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