Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms