Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CHRNEQ04844 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms