Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPS28P8-201ENST00000435020 208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC003666.1-201ENST00000454113 611 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC013472.1-202ENST00000455081 558 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC010907.2-201ENST00000456450 693 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FP325330.1-201ENST00000457518 372 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EGFLAM-207ENST00000506135 889 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC113355.1-201ENST00000510512 491 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AP000867.1-201ENST00000511464 255 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC024451.3-201ENST00000517810 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 IGLV3-29-201ENST00000520084 244 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC117372.1-201ENST00000548633 620 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC015909.4-201ENST00000577175 578 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RN7SL117P-201ENST00000580765 296 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FAM95B1-204ENST00000586273 798 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FAM95B1-207ENST00000589112 768 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FAM95B1-210ENST00000591605 743 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZNF678-205ENST00000608949 929 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AQP4-208ENST00000622234 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 OR1B1-201ENST00000623530 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EAF1-AS1-212ENST00000626521 561 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL157371.2-201ENST00000637813 480 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZNF469-201ENST00000437464 13203 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 GRIA1-202ENST00000340592 3170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NXPE1-201ENST00000251921 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 GOSR2-234ENST00000640138 3408 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL031118.1-201ENST00000607727 2955 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MAPK10-260ENST00000641047 2546 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC074281.1-201ENST00000436419 2081 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 USP28-205ENST00000537706 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CNBD2-205ENST00000538900 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 GSDMC-201ENST00000276708 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PDPN-201ENST00000294489 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC245452.3-201ENST00000413294 162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC006195.1-201ENST00000423599 923 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NDUFA3P6-201ENST00000571486 250 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MIR3125-201ENST00000579927 78 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EDRF1-AS1-202ENST00000593871 592 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC119751.8-201ENST00000597032 156 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC011465.1-201ENST00000599092 328 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DYNC1I1-206ENST00000457059 2393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PRAMEF10-201ENST00000235347 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DMBT1-207ENST00000619379 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PTPN20-201ENST00000374218 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL008729.1-203ENST00000606150 2305 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 WDFY4-201ENST00000325239 10079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ATP6V0D2-201ENST00000285393 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RIPOR2-202ENST00000378023 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TRIT1-203ENST00000441669 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 BMS1P2-202ENST00000532854 1858 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC007614.2-201ENST00000569877 1851 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms