Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms