Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms