Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
USP35Q9P2H5 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
USP35Q9P2H5 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms