Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NLRP1Q9C000 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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