Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SFT2D3Q587I9 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SFT2D3Q587I9 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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