Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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CCDC96Q2M329 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CCDC96Q2M329 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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