Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SS18Q15532 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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SS18Q15532 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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