Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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CNGB1Q14028 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
CNGB1Q14028 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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