Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CUL4BQ13620 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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