Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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