Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTPAP49638 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTPAP49638 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms