Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms