Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TMPOP42166 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
TMPOP42166 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
TMPOP42166 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TMPOP42166 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TMPOP42166 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms