Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RFXAPO00287 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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