Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms