Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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ANKRD42Q8N9B4 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ANKRD42Q8N9B4 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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