Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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