Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
PUM3Q15397 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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