Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms