Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms