Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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FOXE3Q13461 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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