Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM28Q13263 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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