Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
IFT88Q13099 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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