Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXF2Q12947 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms