Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms