Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms