Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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