Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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TDP1Q9NUW8 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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TDP1Q9NUW8 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TDP1Q9NUW8 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TDP1Q9NUW8 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TDP1Q9NUW8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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