Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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