Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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NDUFA9Q16795 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NDUFA9Q16795 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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