Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms