Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMCO1Q147U7 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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