Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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